鄞州校区，位于宁波市鄞州区，主要负责的是浙江药科职业大学所有大一学生的学习。
下设10个二级学院：药学院、中药学院、护理学院、食品学院、健康管理学院、制药工程与生物技术学院、化妆品学院、药商学院、医药数字化技术学院、医疗器械学院。2023年，招收浙江考生共计1278人。大一所有的学生都在该校区就读，大二以后按学校的安排来分校区。
招生专业如下：药学、药物制剂、药物分析、制药工程技术、合成生物技术、化妆品工程技术、药品质量管理、药事服务与管理、企业数字化管理、应用英语、中药材生产与加工、中药制药、中药学、食品质量与安全、食品工程技术、食品营养与健康、医疗器械工程技术、新材料与应用技术、康复辅助器具技术，共计19个。
鄞州校区交通便利，学校对面就是浙江万里学院钱湖校区，到地铁站就几百米，通过地铁可以走遍宁波大大小小繁华地段。学校附近还有宁波口腔医院鄞州分院，看牙也便利。到万达3公里，公交车需要10多分钟。学校附近还有宁波市鄞州区第二医院，看病也非常方便。到宁波汽车东站7公里，公交车需要20多分钟。到宁波站7公里，地铁需要10多分钟。到宁波机场有14公里，地铁需要20多分钟。这个区位远比奉化校区要好太多了，奉化校区作为主校区，牌面是真的不如本部的好。
住宿上，有四人间上床下桌空调。不过随着这几年招生人数不断增加，部分宿舍改为了六人间上床下桌。
（照片源自学校官网）
鄞州校区占地面积偏小，但好处就是交通便利，周围繁华，到奉化校区30公里，全程地面差不多50分钟。学校每个学期都是要完成相应的跑步计划，这个让学生苦不堪言。总体来说，这个校区还是很不错的，值得报考，如果说大学四年都在鄞州校区就读，那这生活必然美滋滋。
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